主要研究方向为高通量单分子与单细胞分析、核酸化学与生物学、功能纳米材料与分子探针等。

1.国家自然科学基金面上项目，21874105，多靶标病原体单分子核酸扩增分析，2019.01-2022.12，66万，在研，主持。

2.，团队和人才支持-青年跟踪类A类，xtr022020008，单细胞核酸分析，2020-01至2024-12，75万元，在研，主持

3.，自由探索与创新-应急类，xzy032020021，基于多重单分子扩增网络的新型冠状病毒多基因检测与绝对定量分析，2020-01至2021-01，30万元，已结题，主持

4.陕西省科学技术厅，陕西省杰出青年科学基金，生物分析化学，2018-01至2020-12，30万元，已结题，主持

5.，“青年拔尖人才支持计划”项目，生命分析化学，2015-09至2021-09，200万元，在研，主持

6.国家自然科学基金委员会，国际（地区）合作与交流项目，31781360253，第一届海峡两岸生物医学前沿交叉学术研讨会，2017-08至2017-12，24.8万元，已结题，主持

7.国家自然科学基金面上项目，31671013，基于微尺度DNA编程界面及合金纳米二聚体串联组装的肿瘤外泌体RNA多元超灵敏SERS分析，2017.01-2020.12，62万，已结题，主持。

8.国家自然科学基金面上项目，21475102，基于毛细管液滴多重不对称MSP/阵列DNA纳米探针的微流控电化学肿瘤多基因甲基化传感新方法，2015.01-2018.12，85万，已结题，主持。

9.国家自然科学基金青年项目，2100509，基于多功能免疫磁珠和微流控芯片的痕量循环肿瘤细胞检测，2011.01-2013.12，19万，已结题，主持。

1.Chen, Feng#; Xue, Jing#; Zhang, Jin; Bai, Min; Yu, Xu; Fan, Chunhai; Zhao, Yongxi*; Differentiated Visualization of Single-Cell 5-Hydroxymethyl pyrimidines with Microfluidic Hydrogel Encoding, Journal of the American Chemical Society, 2020, 142(6): 2889-2896. (IF 14.612)

2.Bai, Min#; Chen, Feng#; Cao, Xiaowen; Zhao, Yue; Xue, Jing; Yu, Xu; Fan, Chunhai; Zhao, Yongxi*; Intracellular Entropy-Driven Multi-Bit DNA Computingfor Tumor Progression Discrimination, Angewandte Chemie International Edition, 2020, 59: 13267-13272. (IF 12.959)

3.Xue, Jing^#; Chen, Feng^#; Su, Li^#; Cao, Xiaowen; Bai, Min; Zhao, Yue; Fan, Chunhai; Zhao, Yongxi*; Pairwise Proximity-differentiated Visualization of Single-cell DNA Epigenetic Marks, Angewandte Chemie International Edition, 2020, 60: 3428-3432. (IF 12.959)

4.Chen, Feng#; Bai, Min#; Cao, Xiaowen; Xue, Jing; Zhao, Yue; Wu, Na; Wang, Lei; Zhang, Dexin; Zhao, Yongxi*; Cellular Macromolecules-Tethered DNA Walking Indexing to Expolre Nanoenviroments of Chromatin Modifications, Nature Communications, 2021, in press: DOI:10.1038/s41467-021-22284-z. (IF 12.121)

5.Wei, Jing#; Wang, Gen#; Chen, Feng#; Bai, Min; Liang, Yan; Wang, Huanting; Zhao, Dongyuan; Zhao, Yongxi*; Sol-gel Synthesis of Metal-Phenolic Coordination Spheres and Their Derived Carbon Composites, Angewandte Chemie International Edition, 2018, 57: 9838-9843. (IF 12.959)

6.Yongxi Zhao*, Feng Chen, Qian Li, Lihua Wang, Chunhai Fan*.Isothermal amplification of nucleic acids. Chemical Reviews, 2015, 115: 12491-12545. (IF 52.758)

7.Feng Chen, Min Bai, Ke Cao, Yue Zhao, Xiaowen Cao, Jing Wei, Na Wu, Jiang Li, Lihua Wang, Chunhai Fan, and Yongxi Zhao* .Programming Enzyme-Initiated Autonomous DNAzyme Nanodevices in Living Cells. ACS Nano. 2017, 11：11908-11914 (IF 14.588)

8.Feng Chen, Min Bai, Ke Cao, Yue Zhao, Jing Wei, Yongxi Zhao*. Fabricating MnO2 Nanozymes as Intracellular Catalytic DNA Circuit Generators for Versatile Imaging of Base-Excision Repair in Living Cell. Advanced Functional Materials. 2017, 27, 1702748 (IF 16.836)

9.Jing Wei, Yaoxin Hu, Yan Liang, Biao Kong, Zhanfeng Zheng, Jin Zhang, San Ping Jiang, Yongxi Zhao*, Huanting Wang*. Graphene Oxide/Core-shell Structured Metal-Organic Frameworks Nano-sandwiches and Their Derived Cobalt/N-doped Carbon Nanosheets for Oxygen Reduction Reaction. Journal of Materials Chemistry A, 2017, 5: 10182-10189. (IF 11.301) （Back Cover）