药学院前身为创建于1939年的西北医学院药理教研室，1971年成立西安医科大学药学系，1996年成立西安医科大学药学院。2000年原、西安医科大学与陕西财经学院三校合并组建新的后，成立药学院。2004年7月学校进行院系调整，成为医学院药学系。2013年6月学校医学教育体制改革，组建了药学院。

学院下设药物化学系、药物分析学系、药剂学系、天然药物化学系、生药学系、药事管理学系、药理学系、临床药学系、药学本科教学实验中心、药学研究生实验教学中心、高级培训研修中心、成果转化中心等单位。2020年全面进驻创新港完成二次西迁，以“健康中国”战略为导向，重构学科布局成立中国西部科技创新港药物科学与技术研究院，下设血管药物研究所、药物筛选与分析研究所、药物安全与监控研究所以及靶向药物研究所。

学院设有药学博士后流动站，药学一级学科博士点、药学一级学科硕士点、药学硕士专业学位和生物与医药工程硕士专业学位授权点以及药物分析学、生药学、药物化学、药剂学、天然药物化学、药事管理学等二级学科硕士点；拥有药学（国家级一流本科专业建设点）、制药工程（国家级一流本科专业建设点）、临床药学三个本科专业，形成了本硕博贯通、协同完备的高层次创新型人才培养体系。药学类核心课程《药理学》、《药事管理学》入选国家级一流课程，《药事管理学》、《天然药物化学》和《药学野外实习》入选省级精品课程和一流课程，药学教学团队入选陕西省教学团队，《药事管理学进展》入选陕西省课程思政示范课程及教学团队。学院注重药学-理学、药学-工学、药学-管理学、药学-临床医学的学科交叉融合，在药物分析学、药理学、药事管理与临床药学等方向具有明显的特色和优势，药理学与毒理学进入ESI学科全球前1%，在国内外具有较大影响力。目前为全国医学教育学会药学教育研究会常务理事单位，为陕西省执业药师培训中心培训点。主办有Journal of Pharmaceutical Analysis(JPA)、Pharmacoeconomicsand Policy（P&P）、《西北药学杂志》等期刊，其中JPA被SCI收录。

学院注重师资队伍建设，形成了结构合理、学识渊博、治学严谨的教学科研队伍。现有教职工92人（含青秀人才、交叉学科博士后等17人），副高以上职称教师64人，博士生导师30人，硕士生导师57人。教师队伍中现有双聘院士1人，兼职教授8人(其中中国工程院院士3人)、教育部“长江学者奖励计划”讲座讲授1人、教育部“长江学者奖励计划”青年学者1人、国家级青年拔尖人才1人等；担任教育部高等学校药学类专业教学指导委员会委员1人、分委员会委员2人；有全国优秀科技工作者2人、卫生部有突出贡献中青年专家2人、国务院特殊津贴专家2人、教育部新世纪优秀人才2人、陕西省杰出青年基金获得者2人、陕西省教学名师2人、陕西省中青年科技创新领军人才2人、吴阶平-保罗·杨森医学药学奖获得者2人，青年拔尖人才计划入选者6人等。

学院不断加强平台和基地建设，现有天然血管药物筛选与分析国家地方联合工程研究中心、国家中医药管理局中药分析（三级）实验室、陕西省天然药物研究与工程重点实验室、陕西省心血管药物工程技术研究中心、陕西省血管性药物工程研究中心、陕西省创新药物研究中心、陕西省卫生改革发展研究中心、西北药品监管科学研究院、陕西省食品药品监督管理局GLP备案实验室、陕西省中医药管理局“七药”资源及抗肿瘤重点研究室、陕西省中医药管理局中药物质基础分析重点研究室等各级各类平台。

学院坚持“四个面向”，立足西部，突出秦巴山区特色药物资源开发，全力投身新药创制和中药现代化，积极开展学科前沿基础研究和面向产业的高技术开发研究。近年来，承担世卫组织国际合作课题、国家重点研发计划、国家科技重大专项、国家科技支撑计划、国家自然科学基金重点项目等200余项，累计科研经费超过1亿元。获国家技术发明二等奖1项、教育部高等学校科学研究优秀成果奖一等奖1项、陕西省省科学技术一等奖4项、二等奖4项，获授权发明专利200余件，发表学术论文1000余篇，出版著作、教材50余部。

学院坚持“为党育人、为国育才”，以培养涵盖药物研发、生产、流通、使用、检验、管理和教育等相关领域，具有浓厚家国情怀、服务西部大开发的药学领军人才和拔尖创新人才为目标。目前在校生合计740余人，其中博士生80余人，硕士生250余人，本科生410余人。至今已累计培养本、硕、博（含留学生）3000余人，毕业生去向包含知名高校、药监部门、药检所、医院药剂科、医药公司等。毕业生中近一半留在西部地区工作，为祖国西部经济社会发展做出了突出贡献。

学院注重开展与合作，“生物医药创新引智基地”入选陕西省高等学校学科创新引智基地，先后与美国哈佛医学院、约翰霍普金斯大学、威斯康星大学、明尼苏达大学，加拿大皇后大学，日本千叶科学大学、大阪大学，英国斯旺西大学，荷兰莱顿大学等数十所大学建立了科研合作关系、海外实习基地和人才联合培养项目，着力培养具有国际视野的卓越药学人才，打造国际化的科研和育人氛围。与斯旺西大学建立国际生物医学研究中心，成立国际药物经济与结果研究学会（ISPOR）中国西北分会、丝路大学联盟健康子盟药物政策合作网络等，参与全球药品安全治理和健康丝路建设发展。聘请多名海外专家担任兼职教授、客座教授，开设前沿课程。近年来连续举办药物分析、药事管理等领域国际会议十余场，在国内外形成了广泛的学术影响力。

药学院将始终以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，以学校“扎根西部、服务国家、世界一流”办学定位为遵循，在西迁精神和抗战迁陕精神的引领下，不断提升办学水平，奋力创建国内一流、国际知名的高水平药学学科，在服务健康中国建设、提升全民健康水平的宏伟事业中，贡献西交药学人的智慧和力量、谱写更加壮丽的西交篇章。