2005年4月4日，决定启用校歌。这次启用的校歌，创作于抗日战争时期，歌词与曲谱保留了原貌。这反映了当代交大人充分肯定这首校歌的思想境界与文化价值，尊重历史，继往开来的务实态度。
我校自1896年创办以来，受形势变化与隶属关系的影响，学校多次更名，因而历史上也创作和吟唱过多首校歌。譬如，1897年有南洋公学师范院院歌--《警醒歌》，1909年有《邮传部高等实业学堂校歌》，1915年有《南洋大学堂校歌》，1926年有《交通部南洋大学校歌》，抗日战争时期又创作了新的《国立交通大学校歌》。以上校歌，除1915年的校歌是对1909年的校歌歌词稍作修改之外，还未出现过完全采用、传唱前校歌的先例。
我校当前决定启用的校歌，是上个世纪40年代创作于抗日战争时期的《国立交通大学校歌》（以下简称《校歌》）。校歌是时代精神的缩影。1937年爆发了震惊中外的卢沟桥事变，日军发动全面侵华战争。8月13日，日军大举进犯上海，11月日军占领上海，徐家汇校舍为日寇强占，我校被迫迁入法租界，借震旦大学与中华学艺社部分房屋继续办学，交大人与日本侵略者继续展开着各种形式的顽强斗争。国难当头，匹夫有责，民族危亡的历史氛围，无疑构成了我校校歌产生的时代大背景。1942年，教育部令渝校为国立交通大学本部，任命吴保丰（嘉谷）为代理校长。1943年4月校庆前夕，吴保丰校长为激励交大人的爱国热忱，在"四十七周年校庆纪念刊"上发表《校歌》，重申了交大的办学理念、特性、精神与传统。
查阅目前仅存的校史文献，可知这首《校歌》出处有二：一是刊登于1943年4月出版的"四十七周年校庆纪念刊"--《交大概况》之中，由交通大学（重庆本部）编印；二是刊登于1944年1月出版的《交大友声》（第一期）之中，由国立交通大学与交通大学同学会联合编印。这两个刊物都将《校歌》特意放在首页位置，均署名萧友梅作曲。歌词分为两段：
“美哉吾校，真理之花，青年之模楷，邦国之荣华，
校旗飘扬，与日俱长，为世界之光，为世界之光。
美哉吾校，鼓舞群伦，启发我睿智，激励我热忱，
英俊济跄，经营四方，为世界之光，为世界之光。”
“美哉吾校，性灵泉源，科学之奥府，艺术之林园，
实业扩张，进步无疆，为世界之光，为世界之光。
美哉吾校，灿烂文明，实学培国本，民族得中兴，
宇土茫茫，山高水长，为世界之光，为世界之光。”
《校歌》的主题思想可概括为三点：（1）交大以培养追求真理、振兴国家的优秀青年为教育目标，要求交大学子能担负起鼓舞同类（群伦：同类），启发民族睿智的责任，激励热忱，英俊济跄（济跄：仪容敬慎貌。语出《诗经·小雅·鼓钟》："济济跄跄，絜尔牛羊。"），经营四方，为推动世界文明而大放异彩；（2）交大以振兴中国的科学、艺术、实业为办学方向，旨在成为民族性灵的泉源、原始创新的基地，依靠"实学"或厚重的专业知识来夯实国家的基础，复兴中华民族，为建设世界一流大学而大放异彩；（3）一代代交大学子，承前启后，继往开来，以母校为美，以母校为荣，校旗飘扬，山高水长（比喻品格高洁，流传久远），交大历史与交大传统将与日俱长，进步无疆。无疑，以上思想与我国当代实施科教兴国战略、加强精神文明建设与全面建设小康社会的思想是一致的。
《校歌》的曲作者--萧友梅（1884～1940），字思鹤，广东中山(原香山)县人。他是我国著名的音乐教育家、作曲家。1927年与蔡元培等人在上海创办中国第一所专业音乐学院--上海国立音乐学院，任教务主任。他致力于音乐教育事业，为创立和发展中国近代专业音乐教育作出了重要贡献，生前还创作了许多表达爱国思想的歌曲，其论著已辑成《萧友梅音乐集》。
公布《校歌》时只署名作曲者而缺失作词者，显然另有隐情。分析零星文献，《校歌》的歌词很可能出自我校国文系主任陈柱之手。因为同期由萧友梅作曲、陈柱作词的《上海市吴淞中学校歌》，其歌词与我校《校歌》有惊人的类似之处。《上海市吴淞中学校歌》的歌词是："江海之旁，城镇之乡，黉（hong）宇峨峨，多士跄跄，几经变乱，终焉见臧。永矢勿懈，为我校之光，为学术之光，为民族之光……"可见，两首校歌的韵脚相同，歌词均以四字句见长，而"为世界之光"与"为民族之光"句式相似，前者以贡献全人类为己任，更符合一所知名大学的实际地位。
陈柱，字柱尊，广西北流人，是著名的国学家。他1912年毕业于南洋大学堂（即交通大学前身）附属中学，是唐文治的得意门生，稍后肄业于交通大学电机科，1929年任交大预科国文教员，1930～1939年担任交大国文系主任、教授，为南社社员。陈柱以诗词擅长，在我校各种刊物及校外报刊上经常发表诗词作品，时常与名人唱和，为他人诗集撰写序跋，著有《待焚文稿》一集、二集等，国内颇具影响。
在校歌的鼓舞下，交大坚韧不拔地履行着"鼓舞群伦"、"灿烂文明"、"英俊济跄，经营四方"、"实学培国本，民族得中兴"、"为世界之光"的神圣职责。交大学子以校歌中"青年之模楷，邦国之荣华"为鞭策，努力实践着自己的宏伟理想与抱负。"美哉吾校"，也深得历届校友的认同、爱戴与呵护，1943年9月，交通大学同学会通过响应"为母校献金运动"，纷纷慷慨解囊，共捐款689700余元，远远超过了原定筹款40万元的目标。
值得一提是，台湾新竹交通大学1975年曾用的校歌沿用萧友梅的曲谱，而歌词作了较大的改动，其歌词是："美哉中华，诞育异葩，吾校启新运，灿烂若朝霞，济济跄跄，沪渝平唐，为经世之学，夺天工之长。开物成务，播化明伦，乘桴兴宝岛，击楫复神京，作教上庠，理工管航，为经世之学，夺天工之长。"歌词除"为经世之学，夺天工之长"包含攀登科学高峰的寓意外，"美哉吾校"改为"美哉中华"，内涵了一个中国的宗旨，而"沪渝平唐"，其中"沪"指"沪校"，"渝"即抗战时以"渝校"为交通大学本部，"平"指北平（京）学校，亦可兼指抗战时迁至贵州平越的交通大学分校（主要由唐院、平院组成），"唐"指唐山学校，四个字概括了交通大学分分合合、颠沛流离、饱经沧桑的校史沿革。惟愿台湾校友，能够化"击楫复神京"为凝聚力，两岸携手，变干戈为玉帛，为促进与实现中国的完全统一作出积极的贡献。
记住历史是为了启迪未来。《校歌》是学校文化精髓的集中体现，是学校优良传统与办学特色的象征。2005年全球隆重纪念反法西斯战争与抗日战争胜利60周年，也是我校110周年校庆的前夕，学校决定启用抗日战争时期的《校歌》，具有十分重要的现实意义和深远的历史意义，就像国歌仍沿用义勇军进行曲一样。让我们永存忧患意识，自强不息，励精图治，高唱《校歌》，为中华民族的伟大复兴，为世界之光，向着创建世界知名大学的宏伟目标，奋勇前进！
